Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms