Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CkbQ04447 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CkbQ04447 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CkbQ04447 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CkbQ04447 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms