Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RelaQ04207 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RelaQ04207 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms