Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scg2Q03517 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms