Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms