Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms