Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms