Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pde1bQ01065 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms