Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf2raQ00941 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csf2raQ00941 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf2raQ00941 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf2raQ00941 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf2raQ00941 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf2raQ00941 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms