Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms