Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Serpina1cQ00896 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms