Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb1Q00420 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb1Q00420 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms