Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms