Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou1f1Q00286 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou1f1Q00286 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms