Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gbp10Q000W5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms