Protein–RNA interactions for Protein: P99024

Tubb5, Tubulin beta-5 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb5P99024 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb5P99024 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb5P99024 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms