Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca2P97929 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brca2P97929 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brca2P97929 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms