Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc1P97496 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcc1P97496 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcc1P97496 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms