Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bop1P97452 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms