Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElocP83940 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElocP83940 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElocP83940 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElocP83940 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElocP83940 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElocP83940 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ElocP83940 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ElocP83940 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ElocP83940 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ElocP83940 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ElocP83940 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ElocP83940 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElocP83940 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElocP83940 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElocP83940 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElocP83940 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElocP83940 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms