Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx1P83917 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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