Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx1P81068 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx1P81068 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx1P81068 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx1P81068 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms