Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx3P81067 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx3P81067 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx3P81067 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms