Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx2P81066 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms