Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx1P80205 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otx1P80205 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Otx1P80205 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Otx1P80205 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Otx1P80205 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Otx1P80205 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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