Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf3P70671 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms