Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb1P70662 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb1P70662 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms