Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms