Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfi1P70338 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms