Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra8P70278 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra8P70278 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Stra8P70278 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms