Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NficP70255 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NficP70255 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NficP70255 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NficP70255 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NficP70255 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NficP70255 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NficP70255 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NficP70255 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NficP70255 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NficP70255 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NficP70255 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NficP70255 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NficP70255 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NficP70255 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NficP70255 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NficP70255 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NficP70255 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NficP70255 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NficP70255 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NficP70255 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NficP70255 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms