Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc9P70170 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Abcc9P70170 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Abcc9P70170 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Abcc9P70170 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Abcc9P70170 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Abcc9P70170 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms