Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SbdsP70122 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SbdsP70122 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms