Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtnP63089 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtnP63089 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtnP63089 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtnP63089 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtnP63089 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtnP63089 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms