Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UbdP63072 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
UbdP63072 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UbdP63072 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UbdP63072 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UbdP63072 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UbdP63072 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms