Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3aP63011 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3aP63011 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3aP63011 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3aP63011 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3aP63011 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3aP63011 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3aP63011 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3aP63011 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3aP63011 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3aP63011 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3aP63011 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3aP63011 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3aP63011 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3aP63011 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3aP63011 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3aP63011 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab3aP63011 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms