Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta2P62737 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta2P62737 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms