Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd1P62315 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms