Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r1P61809 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms