Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms