Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf3P61205 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms