Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp1P60335 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp1P60335 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms