Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms