Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ythdf1P59326 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ythdf1P59326 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms