Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrnp3P59055 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms