Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms