Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms