Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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