Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp5P56399 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms