Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex2P55098 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms